A település első írásos emléke a XIV. századból származik, mely Kacha néven említi. Neve feltehetőleg a Kasa, Kosa személynévből származik. A település a török támadások következtében elnéptelenedett. Kiskassa lakosságának összetétele innentől kezdve igen változatos. A XVII. századi újranépesítés során boszniai rácok érkeztek a településre. A XVIII. században a Batthyányi család uralma alatt szinte teljesen német ajkúvá vált a település, a II. világháborút követően azonban a családok többségét kitelepítették.